问题不清楚:我理解你的问题是 1)我想知道一个 蛋白质 的 空间结构,想查查pdb,但是不知道编号。 这个好办,不需要知道 pdb编号。直接查蛋白质的名字,其他通用的ID就行了。一个蛋白质,视重要程度和实验难度,可能有从几个到上千又或者根本没有结构信息,所以蛋白质和pdb是一对多的关系. 如何从 alphafold2 蛋白质数据库下载 pdb。AlphaFold 是由谷歌的 DeepMind 开发的人工智能程序,用于预测蛋白质结构。 网址:https. pymol如何保存成pdb格式? 小蓝星 · undefined 来自知友的真实反馈 我用pymol 处理多肽后不知道怎样保存为pdb了 显示全部 关注者 12 被浏览
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pdb格式 图片取自:pdbintro 其次,我们需要知道Pymol中显示颜色的方式。Pymol有各种显示颜色的方案,我们这次会利用其能够根据b-factor上色的功能。 Pymol操作为:color选项 >> spectrum >> b-factors 我们第一步要生成一个9x9x9的格子。
5. 恢复原位或重置视图: - 如果你想要恢复分子到原来的位置,可以重新加载原始的PDB文件,或者使用`zoom`命令重置视图回到初始状态: ``` zoom all ``` 另外,你也可以使用`transform`命令来精确地移动分子,这允许你指定平移和旋转的具体参数。
有谁在RCSB PDB网站下载过蛋白质的pdb文件? 怎样从这个网站中下载到某一聚合物中某一个组成部分的pdb文件? 例如由actin何frofilin两种蛋白质通过binding 形成complex,能不能找到complex中actin的pdb文件 关注者 10 分析结束后,在信息中查找“PROCESS_NAME”、“MODULE_NAME” 、 “IMAGE_NAME”和”FAILURE BUCKET_ID“,查看具体错误原因后进行针对性修复。 常见的修复方案有以下几种: 方案一:通过官方渠道更新或者重新安装电脑所有主要硬件 (包括 BIOS、独立和核心显卡、有线和无线网卡、声卡、SATA AHCI等) 的驱动程序. 有没有生物大佬教教我PDB是什么啊?在线等,挺急的!!谢谢辽? 关注者 10 被浏览 11,955 知乎用户 罗格斯新泽西州立大学 化学与化学生物学博士